Functieomschrijving
Voor het Rijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu zoeken wij een Bio Informatician.- Je ontwerpt en implementeert bioinformatica-oplossingen voor pathogeenanalyse (zoals virussen en bacteriën).
- Je onderhoudt, breidt uit en standaardiseert gespecialiseerde bioinformatica-pipelines, geschreven in Python en Snakemake.
- Je ontwikkelt geautomatiseerde rapportage dataworkflows die de klinische respons ondersteunen op basis van analyseresultaten.
- Je zorgt voor kwaliteitsborging en accreditatie van oplossingen die moeten voldoen aan standaarden en principes zoals ISO15189, FAIR data en open-science.
- Je schrijft uitgebreide documentatie die toegankelijk is voor zowel technici als niet-technici om kennis over te dragen.
- Je stemt workflow-, tooling- of rapportagevereisten af met inhoudelijke experts en past geautomatiseerde processen hierop aan.
In 2026 worden verschillende projecten uitgevoerd om bestaande dataverwerkingstools te vervangen en het standaard surveillance data platform te verbeteren. Het is de bedoeling dat binnen korte tijd meerdere onderdelen worden gerealiseerd, waarna de implementatie verder kan worden uitgebreid. Het grotere doel is het verder standaardiseren van datastromen die binnen de publieke gezondheidszorg door het RIVM worden ontwikkeld, zowel voor interne taken als voor het delen van informatie met partners in de publieke gezondheidszorg. Je werkt vooral binnen het team dat in 2026 deze veranderingen tot stand brengt. Kennisoverdracht maakt onderdeel uit van jouw werk, zodat aan het einde van de opdracht alle relevante kennis is overgedragen.
Competenties
- Analytisch vermogen
- Plannen en organiseren
- Samenwerkingsgerichtheid
- Communicatieve vaardigheden
- Nauwkeurigheid
- Creativiteit
Functie eisen
- Je hebt een afgeronde HBO+ opleiding in bioinformatica, moleculaire biologie, (medische) microbiologie of computationele biologie.
- Je beschikt over aantoonbare en gedocumenteerde vaardigheid in Python.
- Je hebt kennis van microbiologie, moleculaire biologie en pathogeenanalyse.
- Je beheerst het Engels professioneel en spreekt minimaal Nederlands op niveau B1.
- Je hebt aantoonbare kennis en/of ervaring in bioinformatica met betrekking tot de analyse van bacteriën, virussen, schimmels of parasieten.
- Je hebt ervaring met workflowmanagementsystemen zoals Snakemake.
- Je hebt ervaring met Git versiebeheer en package management (Conda/Mamba/Pypi, Apptainer/Singularity).
- Je hebt ervaring met SQL en data modelling.
- Je hebt ervaring met machine learning methodologieën en statistische analyse.
Functie wensen
- Je hebt analytisch vermogen: je herkent patronen en verbanden in complexe datavraagstukken en vertaalt deze naar logische, robuuste oplossingen
- Je kunt plannen en organiseren: je bepaalt een gestructureerde en efficiënte werkaanpak voor het ontwerpen, bouwen en beheren van systemen, en bewaakt de voortgang en prioriteiten
- Je bent samenwerkingsgericht: je stemt effectief af met andere bioinformatici, inhoudelijk experts, data engineers en andere stakeholders
- Je bent communicatief vaardig: je kunt makkelijk communiceren met bioinformatici en niet-bioinformatici en bent bereid niet-technici te ondersteunen
- Je werkt nauwkeurig en gericht op kwaliteit
- Je bent creatief: je komt actief met nieuwe ideeën en invalshoeken om de kwalitatieve output van het RIVM te verbeteren
